MANUEL UTILISATEUR

Généralités : gérer la taxonomie avec TaxHub

L’application TaxHub permet de gérer les informations liées à la taxonomie dans votre instance de GeoNature : espèces saisissables sur le module Occtax de GeoNature, informations diverses sur les espèces, enrichissement des fiches espèces de GeoNature-atlas, regroupement des taxons en listes personnalisées, etc.

3 onglets principaux structurent l’application :

  • TAXREF : Dans cet onglet, tout utilisateur connecté ou non peut explorer le référentiel taxonomique. Un utilisateur disposant des permissions suffisantes pourra également ajouter des attributs ou médias à un taxon.

  • LISTES : Cet onglet recense les listes disponibles et permet d’en créer des nouvelles, de les peupler, les modifier et les exporter.

  • ATTRIBUTS : Cet onglet recense les attributs disponibles et permet d’en créer de nouveaux.

Exploration de Taxref

Dans l’onglet Taxref, vous pouvez explorer le référentiel national complet. Vous pouvez ainsi requêter selon différents champs et filtrer les résultats sur ces différentes colonnes, ou encore consulter les fiches espèces sur le site de l’INPN. Pour ces fonctions, il n’est pas nécessaire d’être connecté.

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Cet onglet permet d’explorer le référentiel taxonomique national et de consultrer pour chaque taxon les attributs et médias de votre instance.

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Mettre à jour les informations d’un taxon

Ainsi, les taxons peuvent se voir attribuer un certain nombre d’informations, nommées « attributs », et être classés dans des listes personnalisées.

Afin d’attribuer des informations à un taxon, il faut l’éditer (bouton « crayon » depuis l’onglet Taxref), et renseigner les différents attributs qui concernent l’espèce.

De la même manière, vous pourrez intégrer ce taxon à des « listes » personnalisées. Un taxon peut appartenir à plusieurs listes. Enfin, vous pourrez associer un ou plusieurs médias à un taxon. Ces médias peuvent être des images, des vidéos, des enregistrements sonores, des fichiers PDF etc.

Créer et gérer des listes personnalisées

TaxHub permet d’organiser les taxons au sein de listes personnalisées. Ces listes peuvent répondre à tous types de besoins : espèces invasives, espèces ciblées par un programme d’étude, espèces saisissables dans un module, espèces jugées douteuses dans la base de données de votre organisme etc.

Pour consulter les listes existantes, vous devez aller dans l’onglet « listes ». Vous y verrez et pourrez explorer les listes disponibles (bouton « oeil »), ainsi que les exporter au format csv.

Avec les droits nécessaires, vous pourrez éditer les informations relatives à vos listes. Vous pourrez également associer à la liste en question de nouvelles entités parmi les taxons de votre instance depuis un fichier CSV de cd_nom (bouton « peupler »).

Enfin, vous pouvez créer de nouvelles listes en renseignant les informations relatives à celles-ci (nom, description, éventuellement règne ou Groupe 2 INPN associé). Dans ce cas, seules des taxons du règne ou du groupe pourront peupler la liste en question. Ces restrictions évitent, par exemple, de peupler une liste “insectes pollinisateurs” avec des taxons qui autres que des insectes.

Une fois la liste créée, vous pourrez la peupler ou l’exporter comme vu précédemment.

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Créer et gérer des thèmes et attributs personnalisés

Afin de mieux répondre à vos besoins et attacher les informations dont vous avez besoin à vos taxons, il est possible de créer de nouveaux attributs et de les organiser en « thèmes ». Ces attributs peuvent être organisés en plusieurs thèmes, qu’il est possible d’ordonner.

Par défaut, 4 attributs dans un thème unique (atlas) existent.

Dans notre exemple, un thème est déjà ajouté avec un attribut pour les listes rouges. Un nouveau sera créé pour intégrer une notion d’actions :

Afin d’ajouter et ordonner des thèmes, il faut créer une nouvelle entrée dans l’onglet « Thème ». En créant cette entité, un ordre peut être donné au nouveau thème afin de les ordonner dans l’interface.

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De la même manière, pour créer un attribut, il faut créer une nouvelle entrée dans l’onglet « Attribut »`. Il est alors possible de définir ses modalités possibles (type et valeurs), de l’ordonner et de lui attribuer un thème. Comme pour les listes, les attributs peuvent ou non être limités à un règne ou à un groupe 2 INPN.

Votre application TaxHub est désormais dotée de nouveaux attributs !

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Gérer le contenu de GeoNature-atlas

Les informations « statiques » diffusées sur les fiches espèces sont les suivantes :

  • Les photos (une photo principale, et des photos)

  • Les autres médias : enregistrements sonores, fichiers pdf, vidéos etc

  • Les champs description, commentaires, les milieux et la chorologie.

L’ensemble de ces informations sont rattachées à un taxon sous forme de médias et d’attributs. Les informations des fiches espèces sont donc enrichies en éditant les attributs du thème « atlas », et les médias d’un taxon (voir partie : mettre à jour les informations d’un taxon).